《指挥官2146》采用自由建设的设计，在有限的土地资源上如何建造出更为强大的基地？每个玩家都会规划自己的基地，但各自利用土地资源的能力却各有不同，你是一个出色的规划师么？那么可以在基地里展现一下你的能力。
每个玩家的基地必然是侧重点不同，因此建造内容数量也是不同的，由于《指挥官2146》特别强调兵种的特性优势，因此在建造系统中只允许每个玩家指挥官访问与升级属于自己兵种的关键建筑设施，正因为如此一个基地由三个玩家共同发展使，从而使各个兵种都很强大，基地的生产防卫能力才能更加强大。
《指挥官2146》的矿资源生产方式来自于RTS类战略游戏的生产方式，当矿车越多时产量也就越高，而不是通过对矿不断的升级而获取更高的产量，矿产的多少在细微的调整方面交给了玩家，玩家决定某个资源产量高，或某个资源产量低，而这些变化是瞬间就可以达到的，玩家不会为升错了资源矿而懊恼，战斗中任何资源的细微变化都可能导致武器质量和科技能力的不同，《指挥官2146》理解这些并为所有的玩家建立了更加合理与调整自由的资源生产结构。